Amikor a polgárháború után folytatódott a bajnokság, a legerősebb csapatok az Atlético Aviación, a Valencia és a Sevilla voltak. Míg a legtöbb klub sok játékost elveszített a polgárháború alatt, az Atlético és a Valencia ezt szerencsésen átvészelte, és a legjobbjaikkal tudták folytatni. Ebben az időszakban a Valencia volt a legsikeresebb, 1942-ben, 1944-ben és 1947-ben bajnokok lettek, 1948-ban és 1949-ben pedig a második helyen végeztek. A Sevilla is ekkor élte aranykorát, 1940-ben és 1942-ben másodikok lettek, majd 1946-ban megszerezték történetük eddigi egyetlen bajnoki címét. A 40-es évek végén a Barcelona is szerzett 3 bajnoki címet.